Metoder för att skapa molekylär fylogi baseras vanligtvis på en av följande typer: ekonomi - där det bästa antalet teckenförändringar bäst återspeglar evolutionen.
Grannar-jobb-där största möjliga likhet bäst återspeglar evolutionen. Den maximala sannolikheten är där det träd som har den högsta sannolikheten för reella data under den valda evolutionsmodellen bäst återspeglar evolutionen. Bayesian analys, vilket ger sannolikheten att de grupper som finns i släktskap träd, med hänsyn till data, den evolutionära modellen och a priori ungdomar.
En annan metod som används av vissa paleontologer är stratocladistik, där du kodar stratigrafiska data i en matris på samma sätt som kodning av morfologiska data.
Traditionellt har paleontologer skapat sina hypoteser om släktskap baserat på en kombination av morfologiska data och stratigrafisk placering av arter. Dessa metoder kan dock sällan testas eftersom morfologiska egenskaper som du inte använde som grund för deras fylogenetiska hypotes inte anges. Termer [redigera wikit text] termer i fylogenetisk teori och system inkluderar: Monofyletisk - när en grupp består av alla ättlingar efter en gemensam förfader eller mor.
Med andra ord inkluderar gruppen alla ättlingar till individens närmaste gemensamma förfäder. Den monofyletiska gruppen kallas ibland en klänning. I taxonomi är monofili ett ideal, såsom däggdjur. PARAFLYLI är när en grupp innehåller några, men inte alla, ättlingar till en persons närmaste gemensamma förfäder. I taxonomi är parafilier ett nödvändigt ont, till exempel reptiler.
Polyfili är när medlemmar i en grupp inte har en nära, gemensam förfader. I växtvärlden bildar gröna alger en parafytisk grupp eftersom embryon från markväxter härstammar från gröna alger. Ett annat exempel är Protista-rikena, eftersom växter, svampar och djur som har sitt ursprung i Protista inte ingår, utan behandlas som sina egna kungariken. Polyfiliskt betyder att gruppen innehåller flera grenar på släktskapsträdet, men inte en gemensam förfader.
Ett bra exempel är de gamla gongap Gongap Scrrophulariaceae-växterna.
Den klassiska" Lion Gap Plant " Veronica Veronica visade sig vara närmare besläktad med spa-blad än med andra "Lion Gap-växter", såsom ögonolja och höavrinning. Den senare visade sig vara nära besläktad med snigelväxter. För att uppnå monofytiska grupper kan exemplet med kräftor tillåtas, vilket tillåter grupper av sköldpaddor, bergsreptiler, fåglar och krokodiler, som var och en bildar sin egen klass och därmed bara lämnar en "upplevelse" informell beteckning.
En annan lösning skulle vara att reptilklassen också skulle inkludera fåglar. När det gäller gröna alger skiljs ofta en stor monofyletisk grupp som Klorofyta-divisionen, medan resten fortfarande levereras till den fortfarande paraphytiska Charophyta-divisionen. Ibland kombineras emellertid alla gröna alger av karofyter med alla markväxter för den monofytiska divisionen Streptophyta.
Försvarare anses vara ett stort antal kungariken idag, se eukaryoter. Slutligen, när det gäller Lejongapväxter, har familjen Scrophulaceae delats upp så att de flesta växter av Veronica, Lejongap, gula sporer och andra förs in i familjen av matväxter, medan de halvinvasiva släktena är omfattande, smidda, smidda, i skallerormar, skallerormar.
För att skilja mellan olika betydelser av namn används Sensu Lato-beteckningar ofta i bred mening, med ett stort antal undergrupper, och Sensu Stratctu i snäv mening, med det minsta antalet. Till exempel används Sensu Lato ibland om växtriket också ingår, om du också inkluderar röda alger där.